从2007年1月1日起，新增建设用地土地有偿使用费标准将提高一倍，中央分成部分主要按基本农田面积分配地方。这是刚刚出台的《财政部 国土资源部 中国人民银行关于调整新增建设用地土地有偿使用费政策等问题的通知》的重要内容。根据《国务院关于深化改革严格土地管理的决定》和《国务院关于加强土地调控有关问题的通知》的要求，为保护耕地，强化土地经济调控手段，控制固定资产投资过快增长，促进节约集约用地，11月9日，财政部、国土资源部和中国人民银行联合印发《关于调整新增建设用地土地有偿使用费政策等问题的通知》（以下简称《通知》），对新增建设用地土地有偿使用费有关政策作出了重大调整。
一是新增建设用地土地有偿使用费征收标准提高1倍，并按照实际新增建设用地面积征收。《通知》规定，从2007年1月1日起，新增建设用地土地有偿使用费征收等别划分不变，各等别征收标准在原有基础上提高1倍。针对一些地方不依法办理新增建设用地审批手续和直接向用地单位征收新增建设用地土地有偿使用费的情况，《通知》规定，对于因违法批地、占用而实际发生的新增建设用地，一律按实际新增建设用地面积征收土地有偿使用费；《通知》还进一步明确新增建设用地为农用地和未利用地转为建设用地；新增建设用土地有偿使用费的征收范围：土地利用总体规划确定的城市（含建制镇）建设用地范围内的新增建设用地（含村庄和集镇新增建设用地）；在土地利用总体规划确定的城市（含建制镇）、村庄和集镇建设用地范围外单独选址、依法以出让等有偿使用方式取得的新增建设用地；在水利水电工程建设中，移民迁建用地占用城市（含建制镇）土地利用总体规划确定的经批准超出原建设用地面积的新增建设用地；新增建设用地土地有偿使用费的缴纳主体是市、县人民政府，而不是用地单位。由于新增建设用地调整的是各级政府之间的土地收益分配关系，提高新增建设用地土地有偿使用费标准原则上只会减少地方政府的土地收益，不会增加用地成本。
二是地方新增建设用地土地有偿使用费全额缴入省级国库。新增建设用地土地有偿使用费提高标准后，仍实行中央与地方30：70分成体制。但为避免部分地方不能足额征收新增建设用地土地有偿使用费的问题，《通知》规定，从2007年1月1日起，地方分成的70%部分，一律全额缴入省级（含省、自治区、直辖市、计划单列市）国库。
三是主要参照基本农田面积和土地开发整理重点任务分配新增建设用地土地有偿使用费。新增建设用地土地有偿使用费征收标准提高后，其收入仍然全部用于土地。其中中央分成部分，《通知》规定，由财政部会同国土资源部主要参照各地基本农田面积和国家确定的土地开发整理重点任务分配给各省（自治区、直辖市、计划单列市），并向中西部地区和粮食主产区倾斜，专项用于基本农田建设和保护、土地整理、耕地开发等开支。这一政策不仅彻底改变由中央负责土地开发整理项目具体管理的方式，还将充分调动各级地方政府保护基本农田的积极性。
此外，《通知》对新增建设用地土地有偿使用费征管、收缴程序、清欠、监督检查等也作出了规定。
